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小分子腺苷触发原始细胞内瞬态核酸动态网络

细胞内的动态反应网络,如代谢通路、信号转导和基因调控,依赖于复杂且精密的分子相互作用,这些网络通过瞬时的、耗散性的化学过程实现功能调控。近年来,合成生物学和系统化学的兴起推动了人工模拟天然动态网络的发展,旨在构建具有自适应、反馈和级联功能的合成系统。核酸分子因其可编程性和特异性识别能力,成为构建此类动态网络的理想材料。适配体(aptamer)和DNAzyme等核酸元件能够通过特定配体或环境刺激实现结构的动态重构,为设计智能分子网络提供了丰富工具。然而,现有研究多局限于均相溶液体系,如何在类细胞环境(如原始细胞)中集成并调控这些动态网络,仍是亟待突破的挑战。


近日,中国地质大学黄福建教授、西南大学欧阳煜教授、以色列耶路撒冷希伯来大学Itamar Willner院士等人开发了一种由腺苷(AD)触发的瞬时适体基核酸动态网络,如图1所示,并成功整合到脂质体原始细胞中。通过原始细胞外的小分子AD渗透至原始细胞内并引发多个适体基DNAzyme的有效组装形成动态网络(CDN),并且该网络通过腺苷脱氨酶(ADA)催化转化AD为无结合活性的肌苷,能够实现在原始细胞内动态网络瞬态演化过程。

图1. 由AD触发的四种核酸组分组成的反应模块组装示意图,以产生瞬时运行的AD稳定的组成动态网络CDN


进一步,通过设计光响应笼状DNA发夹,实现光控释放动态网络组分,并利用AD精确调控CDN的时空组装与解离。利用荧光共振能量转移(FRET)和动力学模型验证了AD触发下DNAzyme的瞬态催化活性及CDN的动态演化规律,揭示了AD、ADA浓度对网络耗散速率的调控规律。最终,该体系被拓展至靶向基因治疗领域:通过胆固醇-DNA适配体(AS1411)介导的脂质体-癌细胞融合,将光控释放的ATP响应型DNAzyme递送至乳腺癌细胞(MCF-7)内,如图2所示,利用癌细胞中高浓度ATP激活DNAzyme特异性切割致癌基因EGR-1 mRNA,诱导选择性凋亡(效率达80%),而正常上皮细胞(MCF-10A)未受显著影响。

图2. 负载系链x修饰的脂质体的ATP响应性光激活发夹HEE'与x'-AS 1411功能化的MCF-7癌细胞的融合示意图


该研究通过“小分子/适配体-酶动态驱动—原始细胞集成—精准治疗应用”的创新链条,为合成生物学提供了可编程的细胞模拟平台,同时为癌症治疗开发了高选择性基因编辑工具,兼具基础研究与临床转化价值。


本研究提出的策略具备广泛的基因治疗拓展潜力。例如,可构建由miRNA等生物标志物变构调控的光激活DNAzyme系统,通过识别特定疾病相关miRNA激活酶切功能,实现多样化疾病相关mRNA的精准剪切。此外,基于x/x'互补链与适配体协同的脂质体-细胞靶向融合机制,可进一步扩展应用于CRISPR-Cas系统、动态DNA网络等复杂合成生物工具的定向递送,为多类型基因编辑及智能诊疗系统的开发提供模块化递送平台。


这一成果近期发表在Journal of the American Chemical Society 上,文章的第一作者是耶路撒冷希伯来大学博士后欧阳煜(目前入职于西南大学),通讯作者为Itamar Willner院士、黄福建教授。


原文(扫描或长按二维码,识别后直达原文页面,或点此查看原文):

Adenosine-Triggered Dynamic and Transient Aptamer-Based Networks Integrated in Liposome Protocell Assemblies

Yu Ouyang, Yang Sung Sohn, Xinghua Chen, Rachel Nechushtai, Eli Pikarsky, Fan Xia, Fujian Huang* and Itamar Willner*

J. Am. Chem. Soc.2025, DOI: 10.1021/jacs.5c05090


欧阳煜教授简介


欧阳煜,西南大学化学化工学院教授,国家级青年人才。2020年于南京理工大学取得博士学位,2020年至2011年在以色列耶路撒冷希伯来大学Itamar Willner课题组从事博士后研究工作,2025年3月起就职于西南大学。


研究方向:1.DNA纳米技术与生物传感;2.人工细胞与生物仿生技术;3.核酸功能化纳米催化及其应用。目前共发表SCI论文65篇,其中发表SCI论文19篇,包括Sci. Adv. (1篇),Nat. Commun. (1篇),J. Am. Chem. Soc. (5), Adv. Mater. (1篇), Angew. Chem. Int. Ed. (2篇), ACS Nano (1篇) 等国际权威期刊,总引用次数3000余次,h-index 29。


课题组长期招聘硕士、博士、博士后及科研助理,欢迎有志于从事相关研究的优秀同学加入!


黄福建教授简介


黄福建,中国地质大学(武汉)材料与化学学院教授,国家级青年人才。黄福建教授主要从事响应性核酸器件相关的生命分析检测,DNA纳米技术及DNA凝聚体相关的研究工作。目前为止在Chem. Rev. (1篇),Sci. Adv. (1篇), Nat. Commun. (2篇),J. Am. Chem. Soc. (5篇),Angew. Chem. Int. Ed. (2篇),Nano Lett. (2篇),ACS. Nano (2篇)等期刊发表SCI论文40余篇。主持国家自然科学基金委青年项目1项,面上项目2项,浙江省自然科学基金1项,以课题骨干参与申请并获批自然科学基金委中-以国际合作项目1项、科技部重点研发计划项目1项,湖北省重点研发项目青年项目1项。2022年获得国家青年人才项目资助。


课题组长期招聘硕士、博士、博士后及科研助理,欢迎有志于从事相关研究的优秀同学加入!


https://www.x-mol.com/university/faculty/58180 


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